有效。夫妻双方是可以就双方的合法财产进行处分的，双方签订了婚内财产协议，去公证处办理了公证之后，该协议通常来说是不可撤销的，所以不用担心其法律效力的问题。依据我国相关法律的规定，经公证的民事法律行为、有法律意义的事实和文书，应当作为认定事实的根据，但有相反证据足以推翻该项公证的除外。
法律依据
《中华人民共和国公证法》第三十六条
《中华人民共和国民法典》第一千零六十五条